仓鼠一般没有寄生虫。仓鼠是比较干净和卫生的小动物，但平时也要注意清洁，建议每隔一天给仓鼠用浴沙洗一次澡。其次，也要经常给仓鼠换垫材，夏天可以每周更换两次，冬季可以每周一次。另外，喂养的自然环境要干净卫生，并且屋子还需要自然通风。最后，不能把仓鼠放到地面上，因为地面的病菌很多，很容易让仓鼠生病。
仓鼠身上一般不携带病毒病菌，因为人们养的仓鼠体质比较娇弱，一点照顾不好，它就会生病，严重的病毒有可能会使它丧生，所以，还没等到它传播，就已经扼杀摇篮之中了。对人是没有危害的，不过，如果被它咬到，最好还是要就医的。
