刀背麝香龟在温度下降到15℃以下时就会自主进入冬眠，当温度持续下降到10℃时就会完全进入冬眠，饲养期间需要将温度控制在5℃左右，让刀背麝香龟停留在深度冬眠中，并且随时注意温度的变化防止变温。
刀背麝香龟冬天的时候，温度在17~20度以下，食欲就会减退，到15度以下才会正式进入冬眠。刀背麝香龟冬眠的时候，可以将它放在水中，或椰土和沙子里进行冬眠。并且在刀背麝香龟冬眠期间，要放在温度的稳定的环境中，并保持环境的潮湿。
当刀背麝香龟需要冬眠时，主人需要提前每年的9月份开始给它贴膘，坚持喂食一个月的高脂肪、高蛋白等营养价值高的食物，让刀背麝香龟有足够的脂肪热量度过为期5个月左右的冬眠。另外，主人需要在刀背麝香龟冬眠前一周左右停止喂食，用温水刺激刀背麝香龟食欲，并让它停止进食，加快刀背麝香龟体内的新陈代谢清理肠胃，等刀背麝香龟自主进入冬眠，直到次年温度回升后苏醒。
