多索茶碱和氨茶碱在效果上存在一定的差异。多索茶碱主要是作用于宠物的平滑肌细胞，抑制哮喘的能力比氨茶碱更强。而氨茶碱的主要作用是缓解宠物的支气管粘膜的充血与水肿。多索茶碱在治疗中相对更安全，不会对宠物的消化系统和中枢系统引起副作用。而氨茶碱会对这两个系统造成危害。
虽然氨茶碱的抑制哮喘能力不如多索茶碱，但它具有镇咳作用，这是多索茶碱所没有的。总的来说，多索茶碱和氨茶碱都是治疗哮喘的有效药物，但多索茶碱在抑制哮喘能力上更强，而氨茶碱在缓解支气管粘膜充血与水肿以及镇咳方面具有一定的优势。选择哪种药物取决于宠物的具体病情和需求。在使用任何药物之前，应遵从兽医的建议，并仔细阅读药物说明书，确保药物的安全和有效性。
