鹰嘴龟的喂食分量和时间取决于龟的大小和饲养环境。一般来说，一次投喂的食物量建议与龟的头部大小相仿。投喂频率由龟的大小决定，苗子期间可以一天一喂甚至两喂，成体建议一周一到两喂，保持后腿窝略有肉且不凸起为好。如果过胖，有可能会有脂肪肝病，或者消化不良而导致肠胃炎病，后续调理不当甚至有死亡的风险。
另外，鹰嘴龟更偏爱活体食物，不喜欢植物性的食物。在野外，它们的主食是小鱼、小虾、蚯蚓等，也可以选择性地给它们吃一些动物内脏等食物。在人工饲养的环境下，投喂的食物要保持新鲜，如果有剩余的食物要尽快捞出，防止食物时间过长破坏水质。
