柴犬实际上分为四个品种：信州柴犬、美浓柴犬、山阴柴犬和绳文柴犬。每个品种都有其独特的特点和受欢迎的原因。
信州柴犬：这种柴犬曾经活跃在长野和群马山间的周边，因此很能适应寒冷与高地气候。现今的柴犬体型和信州柴犬基本相同，有人指柴犬的“柴”字就是来源于信州地方的“柴村”一词。一般信州犬体型属小型，其颜色为红色。
美浓柴犬：这种柴犬的毛发近乎红色，这是它与其他柴犬的最大区别。它是古代常见的狩猎犬种之一，体能非常优秀。不过，现时美浓犬已濒临灭绝。
山阴柴犬：这种柴犬的尾巴无法卷曲，因此民间称为“太刀尾”。它的耳朵小而上扬，并大多为全身黑色。
绳文柴犬：这种柴犬是为了还原已灭绝的日本犬祖先绳文犬而改良得到的犬种。它的面部长、足部长，尾巴极卷。“绳文柴犬”这个名字，就是由日本犬保存会给起名的。
